Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OtofQ9ESF1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
OtofQ9ESF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OtofQ9ESF1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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