Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4bQ9ES61 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.2 ms