Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snap29Q9ERB0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms