Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox9Q9EQM5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox9Q9EQM5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms