Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms