Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Swt1Q9DBQ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Swt1Q9DBQ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms