Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atad1Q9D5T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad1Q9D5T0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad1Q9D5T0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms