Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx17Q9D0I4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx17Q9D0I4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx17Q9D0I4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms