Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znhit3Q9CQK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znhit3Q9CQK1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms