Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gtpbp4Q99ME9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtpbp4Q99ME9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms