Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krcc1Q99JT5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms