Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ophn1Q99J31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ophn1Q99J31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms