Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sntg1Q925E1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sntg1Q925E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms