Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apol9aQ8VDU3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol9aQ8VDU3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms