Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8VDP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8VDP2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8VDP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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