Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TmieQ8K467 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TmieQ8K467 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms