Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
1700001C19RikQ8K168 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
1700001C19RikQ8K168 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700001C19RikQ8K168 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms