Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrit1Q8K099 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrit1Q8K099 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrit1Q8K099 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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