Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alx1Q8C8B0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alx1Q8C8B0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Alx1Q8C8B0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms