Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubqln3Q8C5U9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubqln3Q8C5U9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ubqln3Q8C5U9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ubqln3Q8C5U9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ubqln3Q8C5U9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubqln3Q8C5U9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms