Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
SynmQ70IV5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SynmQ70IV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SynmQ70IV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SynmQ70IV5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
SynmQ70IV5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms