Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnot1Q6ZQ08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnot1Q6ZQ08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms