Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn2Q6PHP6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrn2Q6PHP6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms