Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NipblQ6KCD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NipblQ6KCD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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