Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms