Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic3Q62521 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms