Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtafrQ62035 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtafrQ62035 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms