Protein–RNA interactions for Protein: Q60945

Mtcp1, Protein p13 MTCP-1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcp1Q60945 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mtcp1Q60945 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mtcp1Q60945 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms