Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb6Q60692 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmb6Q60692 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms