Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm1Q60636 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm1Q60636 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms