Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm12185Q5NCB2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm12185Q5NCB2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm12185Q5NCB2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms