Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Spsb3Q571F5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spsb3Q571F5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spsb3Q571F5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms