Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Esf1Q3V1V3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Esf1Q3V1V3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Esf1Q3V1V3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms