Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930567H17RikQ3V0K5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms