Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BB287469Q3UT53 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms