Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uspl1Q3ULM6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Uspl1Q3ULM6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uspl1Q3ULM6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uspl1Q3ULM6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uspl1Q3ULM6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Uspl1Q3ULM6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Uspl1Q3ULM6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms