Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samd11Q1RNF8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Samd11Q1RNF8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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