Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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ptchd1Q14B62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ptchd1Q14B62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ptchd1Q14B62 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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