Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MitfQ08874 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms