Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sdr16c6Q05A13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sdr16c6Q05A13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sdr16c6Q05A13 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms