Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sox12Q04890 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sox12Q04890 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sox12Q04890 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms