Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Xrn1P97789 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Xrn1P97789 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms