Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm2aP59997 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm2aP59997 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm2aP59997 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms