Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod1P49813 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tmod1P49813 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmod1P49813 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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