Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb41P48193 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb41P48193 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epb41P48193 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms