Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkn1bP46414 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkn1bP46414 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms