Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp1P29452 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp1P29452 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms