Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb9P28076 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms