Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcmt1P23506 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pcmt1P23506 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms