Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01668 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01668 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01668 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01668 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01668 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01668 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01668 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01668 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01668 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01668 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01668 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01668 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01668 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
P01668 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01668 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01668 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms